Het onderzoek is, naast het onderwijs, een van de primaire taken aan onze universiteit en heeft als zodanig zelfstandige betekenis. Tegelijk is er een nauwe relatie tussen onderwijs en onderzoek: het onderwijs stimuleert tot verdergaand onderzoek, onderzoek komt het onderwijs ten goede. Op deze wijze staat ook het onderzoek in dienst van de opleiding tot de prediking van het evangelie.
Het onderzoek aan de TUA is als volgt gestructureerd:
Onderzoek aan de TUA vindt plaats in de drie onderzoeksgroepen BEST (Biblical Exegesis and Systematic Theology, Kerkgeschiedenis en Kerkrecht, en Vormende Praktijken. Elk van deze onderzoeksgroepen is verder onderverdeeld in onderzoeksdomeinen zoals in de figuur aangegeven.
Onderzoeksgroep BEST (Biblical Exegesis and Systematic Theology)
Onderzoeksgroep Kerkgeschiedenis en Kerkrecht (Church History and Church Polity)
Onderzoeksgroep Vormende Praktijken (Formational Practices)